RNA BASER Sequence Assembler 3.1

Licencia: Gratis ‎Tamaño del archivo: 1.34 MB
‎Calificación de usuarios: 3.0/5 - ‎2 ‎Votos

www.DnaBaser.com Software alineador fácil de usar para el ensamblaje de contig de secuencia de ARN, edición de contig y detección de mutaciones para Windows. Es un software de biología molecular que puede ver y ensamblar secuencias en contigs. Características: clip final, secuencias de exportación, ensamblajes, detección de código. Descripción: RNA Baser es una alternativa asequible para el montaje de secuencias de ARN y generación de contigs. Los formatos de archivo admitidos son abi, scf y seq (o FASTA). Los cromatogramas de las secuencias ensambladas se muestran en un formato sincronizado con el contig generado. Las bases ambiguas en el contig se resaltan y las correcciones son sugeridas por DnaBaser basadas en los valores de calidad de los archivos de seguimiento. Entrada mínima del usuario requerida. Es posible editar bases ambiguas, incluida la inserción y la eliminación. El usuario puede ajustar la configuración del motor de ensamblaje. El usuario puede personalizar la apariencia de cromatogramas, nucleótidos, fondo. Los valores de calidad de los archivos de seguimiento se muestran por encima de los cromatogramas, para que el usuario pueda decidir fácilmente sobre las correcciones en el contig final. Los archivos de cromatograma original se recortan automáticamente en función de los valores de calidad. El contig se guarda automáticamente en formato FASTA, en el mismo directorio con los archivos de seguimiento originales. Mediante el uso de una base de datos construida de secuencias de imprimación y vectoriales, que puede ser editada/actualizada por el usuario, DnaBaser se puede configurar para recortar automáticamente la secuencia vectorial fuera del contig final. Descripción: Software de alineación fácil de usar para la herramienta de secuenciación de ARN, edición de contig y detección de mutaciones para Windows. Es un software de biología molecular que puede ver y ensamblar secuencias en contigs. Características: clip final, secuencias de exportación, ensamblajes, detección de código. Es una alternativa de precio para el ensamblaje de ARN contig. Descargar herramientas de software gratuito para la conversión de archivos. secuencia vectorial de recorte libre programa alinear la base de alineación convertir consenso secuenciación traza mac os x windows mutación primer, calidad pcr en tiempo real.

historial de versiones

  • Versión 3.1 publicado en 2012-03-18
    Ensamblaje de secuencia. Miles de contigs se pueden ensamblar a la vez.

Detalles del programa