El proyecto SourceForge OpenRasMol es un complemento del proyecto RasMol y OpenrasMol en http://rasmol.org. Se espera que el proyecto SourceForge OpenRasMol proporcione un punto focal conveniente para las contribuciones colaborativas activas. Características de RasMol: RasMol es un programa de gráficos moleculares destinado a la visualización de proteínas, ácidos nucleicos y moléculas pequeñas. El programa está dirigido a la exhibición, enseñanza y generación de imágenes de calidad de publicación. RasMol se ejecuta en una amplia gama de arquitecturas y sistemas operativos, incluidos los sistemas Microsoft Windows, Apple Macintosh, UNIX y VMS. Las versiones UNIX y VMS requieren una pantalla X Windows en color de 8, 24 o 32 bits (X11R4 o posterior). La versión X de Windows de RasMol proporciona compatibilidad opcional con un cuadro de marcados de hardware y una comunicación de memoria compartida acelerada (a través de las extensiones XInput y MIT-SHM) si está disponible en el X Server actual. El programa lee en un archivo de coordenadas de molécula y muestra interactivamente la molécula en la pantalla en una variedad de esquemas de color y representaciones de moléculas. Las representaciones disponibles actualmente incluyen estructuras alámbricas de cued de profundidad, palos 'Dreiding', esferas de relleno espacial (CPK), bolas y palos, cintas biomoleculares sólidas y de hebra, etiquetas atómicas y superficies de puntos. La versión X de Windows de RasMol proporciona compatibilidad opcional con un cuadro de marcados de hardware y una comunicación de memoria compartida acelerada (a través de las extensiones XInput y MIT-SHM) si está disponible en el X Server actual. El programa lee en archivos de coordenadas moleculares y muestra interactivamente la molécula en la pantalla en una variedad de representaciones y esquemas de color. Los formatos de archivo de entrada admitidos incluyen los formatos De datos de entrada de Protein Data Bank (PDB), Alquimia y Sybyl Mol2 de Tripos Associates, formato de archivo Mol de Molecular Design Limited (MDL), formato XYZ (XMol) de Minnesota Supercomputer Center (MSC), formato CHARMm, formato CIF y archivos de formato mmCIF. Si la información de conectividad no está contenida en el archivo, se calcula automáticamente. La molécula cargada se puede mostrar como enlaces de estructura alámbrica, enlaces de varillas de cilindros 'Dreiding', trazas de carbono alfa, esferas de llenado de espacio (CPK), cintas macromoleculares (cintas sólidas sombreadas lisas o hebras paralelas), unión de hidrógeno y representaciones de superficies de puntos. Los átomos también se pueden etiquetar con cadenas de texto arbitrarias. Los conformadores alternativos y varios modelos de RMN pueden ser especialmente coloreados e identificados en etiquetas atómicas. Diferentes partes de la molécula pueden ser representadas y coloreadas independientemente del resto de la molécula o mostradas en varias representaciones simultáneamente. La molécula mostrada se puede girar, traducir, hacer zoom y recortar en z (slabbed) de forma interactiva utilizando el ratón, las barras de desplazamiento, la línea de comandos o un cuadro de marcado adjunto. RasMol puede leer una lista preparada de comandos de un archivo 'script' (o a través de la comunicación entre procesos) para permitir que una imagen o punto de vista determinado se restaure rápidamente. RasMol también puede crear un archivo de script que contenga los comandos necesarios para regenerar la imagen actual. Por último, la imagen renderizada se puede escribir en una variedad de formatos, incluidos PostScript ráster o vectorial, GIF, PPM, BMP, PICT, Sun rasterfile o como un script de entrada MolScript o Kinemage. Se puede acceder al centro de ayuda de RasMol escribiendo "ayuda" o "ayuda
historial de versiones
- Versión RasMol_2.7.5 publicado en 2010-12-15
Varias correcciones y actualizaciones - Versión RasMol_2.7.5 publicado en 2010-12-15
Detalles del programa
- Categoría: Educación > Otro
- Editor: www.rasmol.org
- Licencia: Gratis
- Precio: N/A
- Versión: 2.7.5
- Plataforma: linux