NDKmol - molecular viewer 0.97
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acerca de NDKmol - molecular viewer
NDKmol -- Visor molecular para Android • Acerca de la estación de NDKmol es un visor molecular para Android. Puede ver estructuras tridimensionales de proteínas, ácidos nucleicos y moléculas pequeñas. NDKmol soporta la mayoría de las representaciones comunes para moléculas, tales como cinta, traza, palo, esfera y línea. NDKmol también admite operaciones de simetría; se pueden visualizar conjuntos biológicos y embalaje de cristal. Puede buscar y descargar estructuras de RCSB PDB y NCBI Pubchem. NDKmol tiene casi la misma funcionalidad que GLmol, que está escrito en WebGL/Javascript y se ejecuta en navegadores web. Puedes probar GLmol en http://webglmol.sourceforge.jp/index-en.html • Características de la cara de las funciones * Leer archivo PDB o SDF/MOL * Rotar / Traducir / Zoom modelo con el dedo * Representaciones - Línea - Stick - Esfera (radio van der Waals) - Rastro de carbono alfa - Cinta (delgada o gruesa) - Strand - Tubo de factor B - Escalera de ácido nucleico - Línea de ácido nucleico - 'estrellas' solventes * Suavizado de las hojas beta * Colorear - Por cadena - Por estructura secundaria (cuando se define en registros SHEET/HELIX) - Por Elementos - Gradación (también conocido como arco de cadena) - Factor B - polar/no polar * Cristalografía - Visualizar celda de la unidad - Mostrar embalaje de cristal (cuando se define en la sección REMARK) - Visualizar ensamblaje biológico (cuando se define en la sección REMARK) • Cómo usar ? Cuando se inicia, NDKmol carga automáticamente Porin (PDBID: 2POR) como ejemplo. Puede girar la molécula con el dedo. Para ampliar o traducir la molécula, pulse el botón MENU en su teléfono/tableta y seleccione el modo. También se admiten gestos con dos dedos. Todo lo demás se puede hacer desde el MENU. Para cargar otros archivos PDB, coloque el archivo en el directorio "PDB" de la tarjeta SD y seleccione el comando "Abrir" en el MENU. También puede descargar estructuras directamente desde el servidor web RCSB PDB y NCBI PubChem. Seleccione "Buscar y descargar" en el menú. • Contacto ? El sitio web del proyecto se encuentra en http://webglmol.sourceforge.jp/ . Puede obtener códigos fuente para este programa desde aquí. Los comentarios y sugerencias son bienvenidos en http://sourceforge.jp/projects/webglmol/forums/ o [email protected] • Aviso de LICENCIA ? NDKmol está licenciado bajo GNU Lesser General Public License de la siguiente manera. Sin embargo, los archivos PDB incluidos como ejemplos están en condiciones DIFERENTES. Consulte http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=general_information/about_pdb/pdb_advisory.html ------------- NDKmol - Visor molecular para Android (C) Copyright 2011, biochem_fan Este programa es software libre: se puede redistribuir y / o modificar bajo los términos de la Licencia Pública General Menor GNU publicada por la Free Software Foundation, ya sea la versión 3 de la Licencia, o (a su elección) cualquier versión posterior. Este programa se distribuye con la esperanza de que sea útil, pero SIN NINGUNA GARANTIA; sin siquiera la garantía implícita de COMERCIABILIDAD O IDONEIDAD PARA UN FIN PARTICULAR. Ver el Licencia Pública General Menor GNU para más detalles. Debería haber recibido una copia de la Licencia Pública General Menor de GNU